《海军军医大学学报》（原《第二军医大学学报》）创刊于1980年6月，月刊，国内外公开发行，主要报道基础、临床、预防、军事医学以及药学和中国医学等领域的最新科研成果。主要读者对象为医药学领域的中高级科研、医疗人员和高等医药院校的师生。本刊面向全国和海外作者征稿，来稿均经两位以上专家审稿及编委会定稿，刊发论文多数属于国家自然科学基金、国家高技术研究与发展规划项目等重要基金资助课题。采用A4开本，按国际标准编排，附有英文文题、摘要、图(表)题、目次、版权页，铜版纸印刷，彩图随文。