肿瘤相关蛋白EIF4G1亚型的B细胞表位预测

摘要：

目的 预测肿瘤相关蛋白EIF4G1亚型的B细胞表位.方法 下载EIF4G1蛋白各种亚型的氨基酸序列,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合ABCpred和二级结构预测筛选等方法综合筛选EIF4G1蛋白质亚型特异性的B细胞表位.结果 目前已知EIF4G1蛋白的亚型有5种,亚型问的氨基酸变化局限在一个由300个氨基酸形成的序列区域,亚型特异性的B细胞表位可能位于该区域的14～19、21～27、52～61、106～112、113～139、183～189、201～216和217～224位氨基酸残基区域内或附近.结论 EIF4G1蛋白质亚型间存在特异性B细胞表位,这些表位对应用合成肽抗原检测蛋白质亚型和进行肿瘤患者的早期诊断具有重要指导意义.

关键词：真核细胞起始因子4G、蛋白质亚型、B淋巴细胞表位、肿瘤

所属期刊栏目：31

分类号：R730.4(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金30872562;上海市教育委员会科研创新项目08ZZ39

在线出版日期：2010-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：822-825