10.16488/j.cnki.1005-9873.2023.05.001
金针菇三个锌簇转录因子鉴定与表达分析
采用生物信息学方法对金针菇(Flammulina filiformis)3个锌簇转录因子的基本性质、锌簇域和分子进化进行分析,并利用荧光定量PCR研究其在菌丝、原基、菌柄和菌盖中的表达模式.结果表明,Fvzcp1、Fvzcp2和Fvzcp3分布在不同染色体片段重叠群,分别含有9、14、10个外显子,编码序列(coding sequence,CDS)长度分别为2 553、2 634、1 743 bp,对应蛋白质FVZCP1、FVZCP2和FVZCP3的相对分子质量分别为93 763.19、98 333.89、64 251.26,理论等电点分别为7.10、6.54、6.64,均为不稳定的疏水性蛋白质,亚细胞定位于细胞核;FVZCP1、FVZCP2和FVZCP3均具有典型的锌簇域,且其锌簇域类型不同.就表达量而言,与菌丝相比,Fvzcp1在原基和菌盖中较高,Fvzcp2在原基和菌柄中较高,Fvzcp3仅在菌柄中较高;3个基因在菌柄伸长区的表达量均显著高于非伸长区.
锌簇蛋白、锌指蛋白、半胱氨酸、C6型
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Q786;S663.1;S571.1
福建省青年基金项目;校人才引进基金
2023-10-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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