沪农灵芝1号全基因组分析和演化比较

摘要：

对“沪灵芝”(Ganoderma lucidum SH)等23个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进一步选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析.全基因组系统发生分析和分子钟估计结果显示,沪灵芝分化时间(8.75百万年前)明显晚于灵芝属分化时间(180百万年前);基因家族尺寸和直系同源基因数目分析显示,与另外参试灵芝菌种相比沪灵芝基因家族具有一定的收缩趋势;进一步对基因家族数目进行比较的结果显示,沪灵芝逆转录酶家族发生了显著扩增.GO功能分析提示沪灵芝逆转录酶家族的功能富集主要为核酸结合功能和酶的催化活性.

关键词：灵芝、全基因组分析、分子钟、基因扩增、GO功能分析

所属期刊栏目：23

分类号：TS2;R73

资助基金：上海市农科发201310;上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字2014第7-1-7号]、国家自然科学基金31401933

在线出版日期：2016-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-5,19