草菇α-淀粉酶基因的生物信息学分析

摘要：

基于草菇(Volvariella volvacea )基因组和转录组数据,通过生物信息学的方法对草菇α-淀粉酶基因进行基本理化性质、内含子和外显子结构、信号肽、亚细胞定位和功能位点的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明：编码草菇α-淀粉酶的基因有5个,分别为 GME 2151、GME 6695、GME 9075、GME 10698和GME 10705；5个基因编码的蛋白相对分子量介于38.8~64.6 kD 之间,磷酸化以 Ser 位点为主,大都存在信号肽,亚细胞定位在细胞外,保守结构域和空间结构相似度较高。和其它的担子菌一样,草菇α-淀粉酶可以分为两类：GME9075和 GME10698归为α-淀粉酶Ⅰ类,GME2151、GME6695和 GME10705属于α-淀粉酶Ⅱ类。

关键词：草菇、α-淀粉酶基因、生物信息学

分类号：TS2;S85

资助基金：草菇育种岗位CARS 24;黔科合体Z 字2013-4006号的部分研究内容

在线出版日期：2014-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：6-12