橙黄乳菇遗传多样性分析

摘要：

分析来自湖南省道县(DX)、张家界市(ZJJ)、芷江县(ZJ)、麻阳县(MY)和贵州省玉屏县(YP)以及泰国(TL)6个橙黄乳菇种群38个菌株的ITS-5.8S序列的遗传结构和遗传多样性.所有的ITS-5.8S rDNA序列样品共检测到2个变异位点,碱基A、T、G、C的平均含量分别为22.5％、26.9％、22.7％和27.9％.根据序列的核苷酸变异共定义了3种单倍型,其中单倍型Hapolotype 3是湖南和贵州5个种群共享单倍型,Hapolotype 2为6个种群的共享单倍型.中国橙黄乳菇各地区种群的单倍型多样性(haplotype diversity,HD)在0.21875～0.59375之间,表明橙黄乳菇种群具有较高的单倍型多样性.遗传分化指数(fixation index,FST)表明,不同地理种群间的遗传分化较大.AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的17％,种群内部变异占总变异的83％.Mantel测试显示地理距离与种群的遗传分化FST值之间线性关系显著(P＜0.05).采用N-J法构建的分子系统树表明,当与乳菇属相近种进行比较时,湖南、贵州和泰国不同地区的所有橙黄乳菇样品紧密聚为一支.采用中性检验进行分析,推测湖南橙黄乳菇群体样品在进化上遵循中性模型,并且经历过种群扩张过程.研究结果表明橙黄乳菇种群具有丰富的遗传多样性.

关键词：橙黄乳菇、地理种群、遗传多样性、遗传分化、ITS-5.8S序列

所属期刊栏目：19

分类号：S96;S43

资助基金：国家自然科学基金30972371的部分研究内容

在线出版日期：2013-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：29-36