益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置分析

摘要：

目的:对益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置进行分析,旨在为益母草种质资源的开发和利用提供科学依据.方法:采用二代测序技术对益母草全基因组DNA进行测序,并成功组装了其完整的叶绿体基因组.结果:益母草叶绿体基因组全长159 375 bp,由一个大的单拷贝区(LSC) 87 204 bp,一个小的单拷贝区(SSC)17 515 bp和一对27 099 bp的反向重复序列(IRs)组成.基因组注释结果显示其共编码115个基因,包括99个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因.叶绿体基因组GC含量为38.41％.同时,本研究共检测到160个简单重复序列和49个串联重复序列.结论:系统发育分析表明,益母草属与水苏属的亲缘关系较近,本研究为益母草药材精准鉴定与遗传多样性研究奠定了基础.

关键词：益母草、叶绿体基因组、重复序列、系统进化

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分类号：R285.5(中药学)

资助基金：国家质检总局科技计划项目2014IK089;福建省科技计划项目2015Y0031;江苏省2016年度第五期“333工程”科研项目BRA2016498;厦门市科技计划项目3502Z20154079

在线出版日期：2018-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：21-27