基于特征图谱及分子对接预测黄连异喹啉类生物碱成分治疗T2DM的潜在作用机制
目的:基于特征图谱、网络药理学及分子对接技术,对黄连异喹啉类生物碱成分治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制进行预测分析.方法:利用高效液相色谱法对黄连全株药材不同部位的异喹啉类生物碱成分进行定量测定,建立HPLC特征图谱.借助TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库及Uniprot数据库筛选和分析黄连目标化合物及作用靶点,通过Genecards、OMIM、TTD和Drugbank数据库筛选出T2DM疾病靶点基因,使用STRING数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络,对交集靶点蛋白利用Metascape数据库进行GO基因生物学功能和KEGG通路分析,采用Cytoscape 3.7.2软件构建"化合物-靶点-通路"关系网络,最后运用AutoDock Vina软件对核心靶点与作用化合物进行分子对接验证.结果:测定了黄连全株药材不同部位的6种异喹啉类生物碱成分含量,建立了黄连不同部位的HPLC特征图谱,并指认6个特征色谱峰.结合网络药理学分析发现,黄连治疗T2DM的核心靶点有32个,分别是PIK3CA、PIK3R1、SRC、STAT3和MCHR1等,核心作用化合物有10个,分别为氢化小檗碱、小檗红碱、小檗浸碱、小檗碱和药根碱等.GO功能富集在155条细胞组分、2366条生物过程和266条分子功能,主要涉及以醇基为受体的磷酸转移酶活性、蛋白质酪氨酸激酶活性、受体复合体、转移酶活性的正调控、细胞对氮化合物的响应、肽基-丝氨酸修饰、顺行突触信号转导、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、肽基-酪氨酸磷酸化等方面.KEGG富集主要涉及癌症途径、神经活性配体-受体相互作用、乙型肝炎、血清素能突触、Th17细胞分化、胰岛素抵抗等348条作用通路.分子对接验证结果显示,分子结合能＜-5 kcal/mol的占86.67％,氢化小檗碱与MCHR1亲和力最好,结合能达到-8.7 kcal/mol.结论:本研究初步确定了黄连全株药材不同部位生物碱成分组成分布.同时揭示了黄连异喹啉类生物碱成分通过多靶点相互作用,参与多通路的调控以达到治疗T2DM的作用机制,并以分子对接进行验证,为临床运用黄连治疗T2DM提供理论依据.
黄连;特征图谱;HPLC;网络药理学;分子对接;异喹啉类生物碱成分;T2DM
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国家自然科学基金面上项目;国家重点研发计划;四川省重点研发项目
2021-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
115-124
