蟾蜍TNFRSF11b、TNFRSF9基因克隆及生物信息学分析

摘要：

目的:克隆中华蟾蜍肿瘤坏死因子受体超家族(TNFRSF)BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9 基因的全长序列,并分析其序列特征.方法:根据转录组测序所得的TNFRSF11b、TNFRSF9 基因片段设计特异性引物,以中华蟾蜍蟾皮为材料,利用逆转录聚合酶链式反应(PCR)技术获得BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9 基因全长互补脱氧核糖核酸(cDNA)序列,并采用生物信息学手段分析其序列特征,通过实时荧光定量 PCR 方法检测BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9 基因在中华蟾蜍 7 种组织/器官中的表达情况.结果:克隆获得蟾蜍BbgTNFRSF11b基因的全长cDNA序列为 1233 bp,编码 410 个氨基酸,理论相对分子质量为 46.97 kDa,等电点为 8.64,不存在跨膜区及信号肽,为亲水性蛋白,具有多个磷酸化位点.BbgTNFRSF9 基因的全长cDNA序列为 829 bp,编码 247 个氨基酸,理论相对分子质量为 67.874 kDa,理论等电点为 5.12,存在信号肽,为疏水性蛋白,具有多个磷酸化位点,进化树分析发现BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9 基因与其他动物TNFRSF11b、TNFRSF9 基因相似度不高,表明该基因虽有特殊结构域但不同物种间差异较大.组织表达分析显示,BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9 基因在耳后腺中表达显著高于其他部位.结论:成功获得蟾蜍BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9 基因序列,掌握其序列特征,为后续深入研究该蛋白的功能提供参考.

关键词：蟾蜍、基因克隆、序列分析、肿瘤坏死因子受体超家族

所属期刊栏目：25

分类号：R282.7(中药学)

资助基金：重庆市科技局绩效激励引导专项;湖北中医药大学青苗计划资助项目

在线出版日期：2023-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1655-1667