天仙藤全长转录组测序及分析

摘要：

目的:获得天仙藤全长转录组数据库,挖掘天仙藤功能基因.方法:采用PacBio SequeⅠ高通量测序系统,对天仙藤的茎、叶、果 3 个部位的混合样品进行全长转录组测序及分析.结果:共获得 176 354 条环形一致性序列(CCS),获得 184 439 个高质量isoforms,并注释了 139 826 个isoforms,检测出 3058 个转录因子和 135 527 个简单序列重复(SSR)位点,还预测到 76 862 个长链非编码RNA(lncRNA)和 36 204 个mRNAs.结论:获得了较可靠的天仙藤全长转录组数据,可为深入研究天仙藤基因组、生物学特性、相关代谢途径、信号通路及其分子机制提供数据支持.

关键词：天仙藤、全长转录组、测序分析、功能注释

所属期刊栏目：25

分类号：R282.5(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;广西创新驱动发展专项;广西科技计划项目;对发展中国家科技援助项目;中央引导地方科技发展资金项目

在线出版日期：2023-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1473-1485