基于ITS2序列的翻白草与委陵菜分子鉴定

摘要：

目的:应用DNA条形码技术对翻白草及易混品委陵菜进行分子鉴定,保障药材质量和临床用药安全.方法:提取翻白草及委陵菜的基因组DNA,扩增内转录间隔区 2(ITS2)序列并双向测序,所得序列用SeqMan软件校对、拼接;在线双序列比对翻白草对照药材(FR)及委陵菜对照药材(WR)的ITS2 序列,并预测其二级结构;从GenBank下载部分相关序列,运用MEGA X软件进行多序列比对,分析序列变异位点,计算种内、种间遗传距离,采用邻接法(NJ)构建系统进化树.结果:所有样品均成功扩增出ITS2 序列,翻白草和委陵菜的ITS2 序列长度均为 210 bp.双序列比对结果表明,FR与WR的ITS2 序列相似性为 92.9%,二级结构存在明显差异.多序列分析结果表明,翻白草ITS2 序列平均鸟嘌呤(G)+胞嘧啶(C)占比为 63.0%,存在 2 个变异位点,种内遗传距离为0～0.009 6;委陵菜ITS2 序列平均G+C占比为 64.4%,存在 5 个变异位点,种内遗传距离为 0～0.019 3;种间遗传距离为 0.054 8～0.075 8.NJ树结果显示,翻白草、委陵菜聚为不同分支,可明显区分.结论:利用ITS2 序列可以准确鉴别翻白草与委陵菜,为保障其安全用药提供了新的技术手段.

关键词：翻白草、委陵菜、DNA条形码、内转录间隔区2、分子鉴定

所属期刊栏目：25

分类号：R282.5(中药学)

资助基金：山东省药品质量风险监测项目

在线出版日期：2023-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1194-1198