基于高通量测序的当归抽薹相关基因分析

摘要：

目的:筛选与当归抽薹相关的基因并探讨其分子机制.方法:取抽薹和未抽薹当归植株,剪取倒数第三片功能叶中部小叶片,利用BGISEQ-500测序平台对当归叶片基因进行高通量测序,再通过非冗余蛋白(NR)、核酸序列(NT)、Swiss-Prot、InterPro、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、真核生物蛋白相邻类的聚簇(KOG)、基因本体(GO)数据库进行功能基因注释.结果:抽薹当归与未抽薹当归共有936个差异表达基因(DEGs),在公共数据库比对得到867个DEGs,其中505个基因有明确功能,这些功能基因中有182个上调基因.在DEGs中筛选与当归抽薹相关的基因.其中调节细胞生长的基因有CDC48C、CSLA2、CYCA1-1、AUG8、CER26、At1g65390、BTAF1;调节开花的基因有TPS1、ALA6、AP2、SOCI;调节叶片光合作用的基因主要有CAB37、CAP10A.结论:细胞形态建成相关的基因在抽薹当归叶的生长发育过程中发挥了重要作用.抽薹和未抽薹当归差异表达基因的研究丰富了当归基因资源,为进一步开展分子生物学及分子育种研究提供了基础数据.

关键词：当归;抽薹;转录组;差异表达基因

所属期刊栏目：24

分类号：R282(中药学)

资助基金：国家重点研发计划;甘肃省教育厅双一流重大科研项目;甘肃中医药大学扶贫科技专项

在线出版日期：2022-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：243-248