基于DNA条形码的甘草属植物的分子鉴别

摘要：

目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力.方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系统发育树,并基于相似性搜索算法和最近距离法计算各序列鉴定成功率,以分析比较各序列对甘草属的鉴定效率.结果:matk序列因扩增与测序成功率均较低,没有加入后续的数据分析.各个序列的鉴定成功率由高到低的顺序为psb A-trnH、ITS、ITS2、rbcL.ITS和ITS2序列种间最小变异均大于种内最大变异,且种内变异最小.Barcoding gap检验结果显示,ITS、ITS2的重叠区较小.NJ树结果显示,只有psbA-trnH序列能把甘草属不同物种分开.结论:利用DNA条形码序列可准确鉴别甘草属植物,psbA-trnH和ITS组合序列可作为鉴定甘草属植物的较优序列组合.本研究为甘草属植物的分子鉴别提供科学依据.

关键词：甘草属、DNA条形码、分子鉴别、内转录间隔区

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分类号：R282;S567.71(中药学)

资助基金：国家中药标准化项目;国家重点研发计划;国家中药材产业技术体系遗传改良研究室建设;北京市科技计划课题;中医药公益性行业科研专项

在线出版日期：2020-05-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：207-212,218