水稻幼苗期低温胁迫DNA甲基化特征分析

摘要：

为探索低温胁迫下幼苗期水稻全基因组DNA甲基化调控机制,通过对3个耐冷性不同的水稻品种进行3～4℃低温处理试验,利用全基因组DNA甲基化测序(WGBS,whole genome bisulfite sequencing)技术分析低温处理后全基因组DNA甲基化水平及模式变化.结果显示:低温处理后,日本晴和9311的胞嘧啶甲基化(mC)都表现下降,而P427的mC值上升.针对启动子区和转录区发生甲基化的基因进行锚定,发现启动子区锚定的基因数远高于转录区,材料P427锚定的基因最多,9311锚定的基因最少.GO、KEGG富集分析发现,低温处理后P427差异甲基化基因主要富集在二萜生物合成、淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷类生物合成等代谢通路.结果表明:基因启动子区甲基化对低温胁迫响应基因的调控作用更为重要,甲基化调控基因表达不仅与甲基化程度有关,与甲基化类型也可能存在一定的关系.P427可能通过二萜生物合成、淀粉和蔗糖代谢等代谢通路及激素信号转导通路上的基因影响苗期水稻的耐冷性.本研究进一步加深了对水稻耐冷性响应机制的理解.

关键词：水稻、DNA甲基化、低温胁迫、差异表达基因、差异甲基化区域

所属期刊栏目：24

分类号：S572;S831.2;Q945.78

资助基金：贵州省科学技术基金;国家自然科学基金;贵州省科技计划项目;贵州省科技计划项目

在线出版日期：2023-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：376-387