核桃JrCBF基因的克隆与表达和单核苷酸多态性分析

摘要：

根据CBF基因氨基酸保守序列设计简并引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆核桃JrCBF基因cDNA全长序列.用实时荧光定量PCR分析JrCBF基因在低温胁迫下的表达模式,并分析JrCBF基因的单核苷酸多态性.结果获得长度为879 bp的CBF基因cDNA全长序列,编码214个氨基酸,命名为JrCBF;低温能诱导JrCBF基因的表达,4℃处理2h后表达量开始增加,8h后达到最大值;自然越冬条件下,JrCBF基因在花芽中表达量呈现先上升后下降的趋势,在寒冬时期(1月份)表达量最高;单核苷酸多态性分析JrCBF基因序列中有28个SNPs位点和7个Indels标记,存在2个突变热点区;单倍型分析显示15份材料可分为9个单倍型,单倍型多样性为0.9238.本研究为通过基因工程手段培育抗寒核桃品种和分子标记辅助育种提供了帮助.

关键词：核桃、基因克隆、实时荧光定量PCR、单核苷酸多态性

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资助基金：科技部科技基础工作资助项目2013-048;农业部作物种质资源保护项目2014NWB009;山东省农业良种工程项目鲁科农字[2011]086;中俄国际科技合作专项2012DFR30700

在线出版日期：2014-04-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：320-326