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中国野生种葡萄mybA转录因子SNP特征分析

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以中国野生葡萄14个种为材料,对控制花色苷合成的mybA转录因子进行克隆和序列分析,获得VvmybA1和VlmybA2两个转录因子的全长基因序列,共检测到121个SNP,表现出丰富的遗传多样性.3种中性检测方法比较序列变异模式,结果表明,中国野生种葡萄VvmybA1和VlmybA2基因没有偏离中性模型,反映出基因漂移和选择性中性突变之间的平衡.不同野生种材料的mybA基因结构存在很高的同源相似性.但是在启动子区、内含子区以及第3个外显子区存在不同程度碱基的缺失、插入和替换,而且野生种葡萄mybA基因存在一些特有序列或突变,这些突变可以作为分子标记区分不同的野生种材料.通过基因结构比对和系统进化树分析,可将野生种葡萄细分为5个类群.初步推测桦叶葡萄和变叶葡萄进化地位较为原始.

中国野生葡萄、mybA、花色苷、SNP、遗传多样性

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现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-30-yz-1;农业部作物种质资源保护项目NB2012-2130135-34

2013-10-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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植物遗传资源学报

1672-1810

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2013,14(5)

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