大麦干旱胁迫多转录组整合分析及共表达网络的构建

摘要：

干旱胁迫是影响作物生长发育的重要环境条件之一,会导致作物减产、品质下降甚至死亡.作为一种重要的麦类作物,大麦具有比水稻和小麦等谷物更好的抗旱性,被认为是分析作物抗旱性的重要模型系统,本研究整合SRA数据库的6个干旱胁迫RNA-Seq数据集包含的138份各大麦品种样品作为分析数据,对各大麦品种的旱胁迫样本(主要为叶片和根系组织)进行转录组数据分析,得到差异基因14 709个,利用DESeq2进行差异基因分析和富集分析,获得大麦响应旱胁迫的大样本转录表达谱.利用WGCNA整合基因表达数据构建大麦响应旱胁迫的基因共表达网络,从21个模块中筛选出与大麦旱胁迫响应显著相关的tan、greenyellow模块和midnightblue模块,对其进行富集分析,分别筛选出响应旱胁迫的核心基因为36、59和23个.对各模块排名前十的核心基因进行拟南芥同源基因查找,发现如HORVU.MOREX.r3.6HG0631820(NAC)、HORVUMOREXr3.7HG0695480(WRKY)等在其他物种旱胁迫研究中被证明起重要作用的核心基因,表明这些核心基因可能是大麦响应旱胁迫的关键候选基因.本研究构建的大麦旱胁迫共表达网络可为大麦耐旱性改良提供可靠的数据参考和候选基因资源.

关键词：大麦、RNA-seq、旱胁迫、WGCNA、基因共表达网络

所属期刊栏目：60

分类号：S512.3;R737.9;S181

资助基金：国家自然科学基金;青海省昆仑英才;高端创新创业人才项目

在线出版日期：2024-06-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共17页

页码：697-713