高羊茅FaCCA1基因克隆、表达分析及基因编码蛋白的亚细胞定位

摘要：

生物钟节律基因(circadian clock gene)CCA1在植物光周期途径中具有十分重要的作用.以高羊茅'黔草1号 cDNA为模板,利用同源扩增结合cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术从高羊茅中获得与拟南芥CCA1高度同源的cDNA全长序列,命名为FaCCA1.利用BLAST在线软件对该基因进行生物信息学分析,通过农杆菌介导的烟草瞬时表达,观察FaCCA1基因编码蛋白的亚细胞定位,并利用RT-qPCR技术分析不同光照条件下FaCCA1基因表达水平.结果表明,该序列cDNA全长为2 433 bp,含有一个完整的开放阅读框,长度为2 148 bp,编码蛋白含有715个氨基酸,蛋白分子量为77.80 kDa,理论等电点为5.91.亚细胞定位结果显示FaCCA1基因所编码的蛋白定位于细胞核.系统进化树分析表明FaCCA1与禾本科植物的CCA1蛋白亲缘关系较近,其中与大麦亲缘关系最近,达到80％以上.FaCCA1基因表达量在长日照高于短日照,表达水平出现昼夜节律钟变化模式,表明高羊茅FaCC41表达量受光周期调控.这为高羊茅FaCCA1基因的功能研究提供参考资料,为高羊茅的分子育种利用提供了改良靶标.

关键词：高羊茅;FaCCA1;亚细胞定位;表达分析

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资助基金：国家自然科学基金;贵州省科技计划

在线出版日期：2021-11-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1767-1777