利用全基因组关联分析获得白菜A01染色体定位的霜霉病抗病位点和相关分子标记开发

摘要：

本研究对202份大白菜自然群体材料进行简化基因组测序(Speciifc Locus Ampliifed Fragment Sequencing, SLAF),并通过测序深度、SLAF标签的多态性与参考基因组的相似程度等指标的筛选,获得了全基因组均匀分布的960个SLAF分子标记。结合相应材料的霜霉病病情调查结果,利用所述960个SLAF标记进行全基因组关联分析。结果显示：(1)在A01染色体上检测到1个新的与抗霜霉病关联的SLAF标记,即SLAFMarkerA0124655323；(2)根据SLAFMarkerA0124655323左右两翼最近标记之间的距离确定此热点区间为A01染色体24573724~24755150的物理范围；(3)利用该区间内的一个SNP开发出适用于KASP分型技术的SNP分子标记,在各亚群选择准确率均在80%以上；(4)在此区间找到抗病相关基因13个。本研究获得的新的抗病位点和开发的SNP分子标记,将有助于大白菜抗霜霉病分子育种。

关键词：大白菜、霜霉病、全基因组关联分析、简化基因组测序、竞争性等位基因特异性PCR

所属期刊栏目：52

分类号：S512.1;S634.1;Q789

资助基金：国家自然科学基金31401875

在线出版日期：2016-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：693-702