丹参中硫堇基因SmTHI的克隆和表达分析

摘要：

丹参EST序列的Blast分析表明,一条序列与硫堇(thionin,THI)基因有较高的同源性,该序列长575 bp,包含1个长366 bp的开放阅读框(ORF),编码121个氨基酸,命名为SmTHI,GenBank登陆号为DQ212984.在此基础上设计引物,分别从cDNA和gDNA水平上克隆到该基因的全编码区序列的结果表明,该基因无内含子.序列分析表明,该编码蛋白与大多数植物的THI蛋白前体高度同源,并符合植物硫堇类蛋白的序列模式和特征:C-C-X(5)-R-X(2)-”FY”-X(2)-C,N端具17个氨基酸的信号肽,中间46个氨基酸为成熟THI部分,C端的58个氨基酸为酸性多肽部分.成熟的THI蛋白带正电荷,偏碱性,推测可能有抗病原微生物活性.实时定量PCR检测SmTHI在丹参不同组织部位的表达以及在黄瓜细菌性角斑病菌(PSL)、NaCl和水杨酸(SA)溶液诱导下的表达结果表明:SmTHI在植物的根、茎和叶中均有不同程度的表达,其表达丰度为叶＞茎＞根:在PSL、NaCl和SA溶液诱导下该基因的表达呈上调趋势.

关键词：丹参、硫堇、克隆、实时定量PCR

所属期刊栏目：45

分类号：S5(农作物)

资助基金：国家科技支撑计划2006BAI06A12-04

在线出版日期：2010-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：869-874