基于生物信息学分析艾叶治疗慢性荨麻疹的分子机制

摘要：

目的 运用基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)基因芯片挖掘、生物信息学及分子对接技术,分析艾叶治疗慢性荨麻疹(chronic urticaria,CU)的分子机制.方法 从GEO数据库下载CU的基因芯片数据集,利用R软件筛选出差异表达靶点,从中药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP)、药物靶标识别平台(Pharm Mapper)等数据库获取艾叶的化学成分、药物靶点,运用GENEMANIA平台及R软件,对药物-疾病交集靶点进行蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)富集分析,使用AutoDock Vina等软件进行分子对接验证.结果 得到CU靶点 320 个、药物靶点 382 个,筛选出药物-疾病交集靶点 20 个;PPI拓扑分析得出的核心靶点有ADAMTS4、FABP7、SRM、PDE5A、SOD2 等;相关的化学成分有(2R)-5,7-二羟基-2-(4-羟苯基)、亚油酸乙酯、豆甾醇、槲皮素等;富集出涉及脂质和动脉粥样硬化、长寿调节信号通路、过氧化物酶体增殖活化因子受体(peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR)信号通路、白细胞介素(interleukin,IL)-17 信号通路、趋化因子信号通路等;9种化学成分与 5 个核心靶点间的分子对接显示,有 40 组对接具有结合活性(结合能<-4.25kcal/mol).结论 艾叶对CU 具有多靶点、多成分、多途径的作用机制,通过文献检索及分子对接验证本次分析结果具有可信性,可为后期的实验研究提供参考依据.

关键词：生物信息学、分子对接、慢性荨麻疹、作用机制

所属期刊栏目：61

分类号：R285(中药学)

资助基金：丽水市科技计划项目2021SJZC042

在线出版日期：2023-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：25-29