扬州蚕豆病毒病的鉴定及野豌豆潜隐病毒M扬州分离物基因组克隆及其序列分析

摘要：

对田间疑似病毒侵染的蚕豆样品,提取总RNA,分离siRNA,建库并通过高通量测序,其结果经velvet拼接组装,经Blastn与NCBI比对分析,发现该样品感染4种病毒:野豌豆潜隐病毒M(vicia cryptic virus M,VCV-M)、野豌豆潜隐病毒(vicia cryptic virus,VCV)、紫云英矮宿病毒(milk vetch dwarf virus,MDV)和三叶草黄脉病毒(clover yellow vein virus,ClYVV).其中,有14条VCV-M相关的contigs.RT-PCR扩增并拼接获得VCV-M-YZ基因组,其长度为3 434 nt,其5'-UTR和3'-UTR分别为142 nt和117nt,各自形成与该属代表病毒南方番茄病毒(southern tomato virus,STV)5'-UTR和3'-UTR相似的高级结构,且A+U含量均较高.VCV-M-YZ与已报道的VCV-M基因组序列一致性在98％以上.系统进化分析表明,VCV-M-YZ与已报道的VCV-M属于一个种,无明显的地理分布差异.本研究结果丰富了VCV-M群体的基因组遗传信息,为VCV-M的监测及深入研究提供了基础.

关键词：蚕豆病毒、siRNA测序、核苷酸、序列分析

所属期刊栏目：50

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;江苏省高等学校自然科学研究项目;江苏省自然科学基金

在线出版日期：2020-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：311-319