基于原噬菌体类型的我国柑橘黄龙病菌种群遗传结构分析

摘要：

柑橘黄龙病是柑橘生产上最严重的病害之一,由难培养的候选韧皮部杆菌亚洲种(“Candidatus Liberibacter asiaticuS”,CLas)引起.目前,已报道的与CLas相关的原噬菌体有3种,并且不同的CLas样品中可以检测到不同类型的原噬菌体或不同类型的组合.本研究基于原噬菌体类型特异引物对从我国南方8省收集的548个黄龙病样品进行原噬菌体类型的鉴定和分析.结果 表明,基于原噬菌体类型,在548个样品中共鉴定了7种类型的菌株,分别为Type 1(7.12%)、Type 2(60.22%)、Type 3(3.83%)、Type 1+Type 2(3.28%)、Type 1+Type 3(17.34%)、Type 1+Type 2+Type 3(3.47%)和None类型(不含上述3种类型原噬菌体)(4.74%),其中只携带Type 2类型原噬菌体菌株为华南地区优势种群.此外,基于遗传多样性和遗传距离对我国南方地区的CLas种群进行种群结构分析发现,我国南方地区的CLas种群可以分为3个组,即Ⅰ组(广东、江西、广西、福建)、U组(浙江和湖南)以及Ⅲ组(云南和海南),其中Ⅰ组和Ⅱ组又可聚为一大组.该结果可为研究我国柑橘黄龙病流行规律提供一定的理论基础.

关键词：柑橘黄龙病、原噬菌体、种群遗传结构

所属期刊栏目：49

分类号：S432.44(病虫害及其防治)

资助基金：国家现代农业柑橘产业技术体系CARS-26专项经费资助

在线出版日期：2019-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：334-342