水稻黑条矮缩病毒江苏玉米分离物全基因组序列及进化分析

摘要：

利用RT-PCR从江苏玉米上克隆水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)的全基因组,其基因组10个片段核苷酸数目和蛋白编码情况与已报道的RBSDV分离物基本一致.基因组的序列一致性分析和系统进化树表明,RBSDV基因组片段间存在频繁的RNA重排现象;江苏玉米分离物(JS)与湖北玉米分离物(HuB)和河北小麦分离物(HeB)的整体亲缘关系较近,而与安徽分离物(AH-MX8)的整体亲缘关系最远.综合本研究及前人对S8和S10的研究,RBSDV基因组不同片段的进化中RNA重组的作用不同:S1、S2和S4中没有RNA重组;S3、S5、S6、S8和S10中存在低频率重组;S7和S9存在较高频率重组,其中S7的高频率重组尤为显著.

关键词：水稻黑条矮缩病毒、系统进化树、重组、重排、进化

所属期刊栏目：46

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金;山东省自然科学基金

在线出版日期：2016-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：443-452