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10.16688/j.zwbh.2017435

西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析

引用
对30个西瓜枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.niveum菌株基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析,以探究其遗传多样性与地理来源的关系.采用尖孢镰刀菌西瓜专化型Fusarium oxysporum f.sp.niveum0、1、2号生理小种的基因组DNA为模板,对225对SRAP引物进行筛选,筛选出20对多态性、重复性较好且条带清晰的引物,对30个菌株进行PCR扩增,共扩增出386条带,其中多态性条带有371条,多态性比率为96.11%,平均每对引物扩增出19.3个位点和18.55个多态性位点.UPGMA法聚类分析结果显示,供试菌株两两之间的遗传相似系数范围为0.69~0.90,平均为0.79,说明尖孢镰刀菌西瓜专化型的遗传多样性较为丰富.基于SRAP标记聚类分析表明,30个菌株在遗传相似系数为0.70处被划分为3个类群,Ⅰ类群包含24个菌株,其中18个来自湖南省,Ⅱ类群只包含1个来自黑龙江省哈尔滨市的菌株,它和另一个来自黑龙江地区的菌株被划分到不同的类群,且遗传距离相对较远;Ⅲ类群包含了5个菌株,其中3个来自海南三亚,其余两个来自湖南省.根据菌株的分布情况来看,菌株的聚集与地理来源没有明显的相关性.

西瓜枯萎病菌、SRAP分析、遗传多样性

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S436.5(病虫害及其防治)

国家公益性行业农业科研专项201503110-03;湖南省自然科学基金2016JJ2075;湖南省现代农业蔬菜产业技术体系建设专项

2018-12-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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