甘蓝型油菜BnKNOX基因家族的鉴定与分析

摘要：

植物特异的KNOTTED-LIKE HOMEOBOX(KNOX)蛋白属于转录调控因子家族,该家族在植物生长发育过程和各种胁迫应答中发挥着重要的作用.KNOX蛋白中存在4个保守的结构域:TALE(three amino acid loop extension)类型的HD(homeodomain)、ELK结构域,以及 2 个亚结构域KNOX1 和KNOX2.目前,甘蓝型油菜的BnKNOX基因家族还未有系统的研究报道.本研究通过生物信息学分析鉴定获得甘蓝型油菜的 36 个 BnKNOX 家族成员.通过序列比对和系统发育树分析,将其分为 3 个亚家族(I、II 和 M 类).进化分析表明,全基因组复制(whole genome duplication,WGD)和片段复制(segmental duplication)是BnKNOX基因家族扩张的主要动力.基于甘蓝型油菜不同发育时期组织/器官的 RNA-seq 分析发现,该基因家族的 BnKNAT25/26/29/30 在胚乳和种子发育过程中特异表达,而BnKNAT31/32/34 在成熟种子中高表达.通过 BnKNOX 家族的顺式作用元件分析和非生物胁迫条件下的表达模式分析,本文鉴定获得 17 个响应干旱和渗透胁迫的BnKNOX成员.

关键词：甘蓝型油菜、KNOX、基因家族、表达模式、非生物胁迫

所属期刊栏目：49

分类号：TK227.1;S852.61;S512.1

在线出版日期：2023-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共16页

页码：2991-3006