绿豆SSR标记的开发及遗传多样性分析
SSR标记以其数量丰富、多态性好、共显性遗传等优点在基础研究和育种工作中发挥了重要作用,但目前绿豆基因组中的SSR标记依然较少.本研究将磁珠富集法和测序技术相结合高通量检测绿豆基因组SSR位点,鉴定出3,275,355个SSR位点,开发了2742个SSR标记.选取其中157个SSR进行PCR验证,发现有90个(57.33％)标记在10份材料中表现出多态性.挑选40个条带清晰、多态性高、染色体上均匀分布的标记对90份绿豆资源进行遗传多样性分析,单个位点检测到的等位变异数为2～8个,平均为3.0个,有效等位基因数为1.31～4.21个,平均为2.16.Nei's基因多样性指数在0.23～0.76之间,平均为0.51.多态性信息含量为0.22～0.72,平均为0.43.聚类分析将90份材料分为2个类群,包含4个组.第I组主要由北方资源组成,第II组种质来源较为分散,第III组主要由山东的资源构成,第IV组包含多数河北的种质资源.本研究开发的多态性SSR标记不仅可以用于绿豆种质资源的遗传多样性分析,也将在高密度遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种中发挥重要作用.
绿豆、测序、SSR、引物设计、遗传多样性
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安徽省农业科学院科研项目18T0206;国家现代农业产业技术体系建设专项CARS-08-Z11;国家重点研发计划项目2016YFE0203800
2019-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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