花生膜联蛋白基因家族成员的结构和表达分析
植物膜联蛋白(annexin)是一类钙依赖性磷脂结合蛋白,参与调控植物代谢和生长发育并协同调节抗旱、耐盐等多种抗逆反应,其结构在不同植物中具有物种特异性.为系统分析花生膜蛋白基因家族,对30个花生annexin(annexin of Arachis hypogaea,AnnAh)基因进行了生物信息学分析.结果表明30个AnnAhs不均匀分布在13条染色体上,其中A、B基因组中各有13个和17个.AnnAhs含有2～8个内含子,但大多数含有5～6个内含子.聚类分析表明,植物annexin聚类关系比较复杂,低等植物、单子叶、双子叶植物annexin间隔分布,AnnAhs穿插其中,分布于各个分支中;但在各个小分支中,AnnAhs基本上都与双子叶植物annexin聚在一起,其中与大豆、苜蓿、向日葵亲缘关系较近,其次是拟南芥;但个别AnnAhs与单子叶植物和低等植物annexin聚在一起.30个AnnAhs均无跨膜结构域,其中有16个AnnAhs定位于细胞质,其余定位不明确.对AnnAhs可变剪切分析显示,仅有11个发生可变剪切事件,占38％;根中发生的最多,其次是叶中,种子中最少.根据表达谱数据分析发现,AnnAhs在seed2和根中表达量较高,其次是seed1,在叶中表达量较低.本文可为花生抗性育种提供一定的理论支撑.
花生、膜联蛋白、基因结构分析、可变剪切分析、表达模式分析
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山东省自然科学基金重大基础研究项目;山东省农业科学院农业科技创新工程项目CXGC2018B05;山东省自然科学基金项目ZR2014YL043
2019-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
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