陆地棉微管结合蛋白CLASP家族基因的鉴定及表达分析

摘要：

CLASP蛋白(CLIP-associated protein,CLASP)是一种调节微管结构与功能的微管结合蛋白,在植物生长发育及形态建成过程中起着至关重要的作用.本研究利用生物信息学的方法,在陆地棉基因组数据库中鉴定出6个编码CLASP蛋白的基因.多重序列比对及系统进化树分析表明,陆地棉CLASPs可分为2个亚家族(I和II),亚家族I含有HEAT重复结构域和典型的CLASP-N端结构域,亚家族II只含有CLASP-N端结构域.实时荧光定量PCR结果表明,6个CLASPs基因在棉花各组织中均有表达,但表达模式各不相同,其中CotAD_63740(GenBank登录号为KX881965)和CotAD_04861(GenBank登录号为KX881961)在纤维中优势表达,CotAD_48232(GenBank登录号为KX881962)、CotAD_48665(GenBank登录号为KX881963)、CotAD_55570(GenBank登录号为KX881964)和CotAD_68468(GenBank登录号为KX881966)在茎中优势表达,表达模式的不同表明CLASPs在棉花不同组织中功能不同.本研究为深入研究棉花CLASPs的功能奠定了基础.

关键词：陆地棉、微管结合蛋白、微管、表达分析

所属期刊栏目：43

分类号：R24;TP3

资助基金：国家自然科学基金项目U1128301;新疆生产建设兵团博士资金专项2013BB003;石河子大学高层次人才启动项目RCZX201218资助.This study was support by the National Natural Science Foundation of ChinaU1128301;the Special Research Funds for Doctor of Xinjiang Production and Constraction Crops2013BB003;the Startup Project for Outstanding Scholars of Shihezi UniversityRCZX201218

在线出版日期：2017-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：389-398