藜麦EST-SSR的开发及通用性分析
藜麦因营养均衡受到越来越多的关注,但尚未深入开展其基础研究。开发微卫星序列重复 SSR 分子标记将为藜麦的遗传分析提供重要资源。本研究利用NCBI数据库中藜麦RNA测序RNA-Seq及表达序列标签EST数据挖掘、验证及评价藜麦EST-SSR,共发现1862个藜麦非单核苷酸EST-SSR。其中,二核苷酸重复最多(38.3%),六核苷酸重复最少(11.7%)。不同重复类型SSR的数量随着核苷酸数目的增加呈下降趋势。在随机选取验证的119个EST-SSR标记中,66(55.9%)个能够扩增出清晰条带,39个在4份藜麦资源中具有多态性,且其多态性与重复序列长度不具有显著相关性。t测验显示,多态性EST-SSR在藜麦与其他藜科种质间不存在显著差异,说明其具有良好的通用性,可用于藜科物种的遗传关系分析。
藜麦、EST-SSR、分子标记、遗传关系、通用性
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R73;S88
江苏省农业科技自主创新资金项目[CX142044]和美国国际发展署Securing Water for Food Award-salt Tolerant Quinoa子项目UR4443 B资助。This study was supported by Jiangsu Agriculture Science and Technology Innovation Fund [CX142044] and the subproject of “Securing Water for Food Award-salt Tolerant Quinoa”from USAID UR4443 B
2016-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
492-500
