大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4（GmSHMT）的CAPS/dCAPS标记开发和利用

摘要：

大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode, SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance toHeterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(GmSHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS (Rhg4-389)和dCAPS标记(Rhg4-1165),并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明, Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001, r2=0.87),可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型,稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN 3号小种抗性鉴定分析发现, Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质,它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆 SCN 抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/dCAPS标记,且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的“本底”,为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。

关键词：大豆胞囊线虫、Rhg4、CAPS/dCAPS标记、单倍型、分子标记辅助选择

分类号：S56;S5

资助基金：国家自然科学基金项目31171575;中国农业科学院科技创新工程作物分子标记技术及其应用项目资助。

在线出版日期：2015-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1463-1471