花生转录因子基因NAC4的等位变异分析
NAC 转录因子在植物应答非生物胁迫中起重要作用。利用生物信息学分析推测花生栽培种转录因子基因AhNAC4(登录号为 HM776131.1)属于抗旱相关转录因子基因,对比栽培品种山花11号 AhNAC4的2条 cDNA序列(ShrNAC4-a和ShrNAC4-b)及其相应的DNA序列(ShNAC4-a和ShNAC4-b)表明,AhNAC4全长为1244 bp,编码区长度为1050 bp,含有2个内含子,分别位于182~279 bp和547~642 bp处,编码蛋白包含349个氨基酸。从抗旱性不同的32个栽培品种分离得到4类AhNAC4,分别命名为AhNAC4-a1、AhNAC4-a2、AhNAC4-b1和AhNAC4-b2,缩写为a1、a2、b1和b2。a1和a2为等位基因,二者在717 bp处存在1个碱基差异,引起第174位氨基酸的改变,b1和b2为等位基因,二者存在14个SNP位点,其中717 bp和924 bp处碱基的差异引起第174位和第244位氨基酸的改变。供试品种中基因型为 a1a1b1b1、a1a1b2b2、a2a2b1b1、a2a2b2b2的品种数分别为10、5、15和2。从19个野生种中分离得到11类 NAC4的 DNA 序列(Aw1NAC4–Aw11NAC4), Aw1NAC4与栽培种 b1、b2的核苷酸序列同源性最高, Aw2NAC4与栽培种a1、a2核苷酸序列同源性最高。推测栽培种a1基因编码蛋白对花生抵御干旱起关键作用, a1和b1基因编码蛋白的功能与野生种更接近。
花生、转录因子、NAC、等位变异
S56;S64
山东省花生良种产业化工程项目,山东省现代农业产业技术体系花生创新团队建设项目SDAIT-05-011-02;国家现代农业产业技术体系建设专项CARS-14;国家“十二五”科技支撑计划项目2011BAD35B04;国家自然科学基金项目31271757资助。
2015-01-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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