GenBank数据库中黄麻EST-SSR标记的开发及其通用性评价

摘要：

从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签838条,利用SSRPrimer软件对其进行SSR位点查找,利用Primer 3.0软件设计66对SSR引物,通过琼脂糖凝胶研究这些SSR引物的PCR扩增特点,以检测其多态性.结果表明,66对SSR引物在黄麻属6个不同类型材料的扩增中,42 (63.6％)对引物至少在2个材料之间存在多态性.(AT)n重复基元和(GC-)n丰富的三核苷酸重复基元多态性较高,可作为黄麻SSR标记引物设计的首选.黄麻EST-SSR标记开发效率较高,不仅可以丰富黄麻分子标记的数量,而且为剖析黄麻重要性状的遗传机制奠定基础,这对于黄麻的遗传基础研究具有重要应用价值.

关键词：黄麻、EST、SSR、标记开发、多态性

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分类号：TP3;TU9

资助基金：高等学校博士学科点专项科研基金新教师类资助课题20133515120002;国家现代农业产业技术体系建设项目CARS-19-E06;农业部东南黄红麻实验观测站农科教发2011;国家自然科学基金项目31000734

在线出版日期：2014-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1213-1219