全基因组分析玉米MuDR转座因子插入突变体库

摘要：

在功能基因组研究中,插入诱变被广泛用于基因敲除.玉米Mutator转座子因其具有较高的转座活性常被用于构建大型玉米插入突变体库.本研究利用具有活性MuDR因子的玉米材料与优良玉米自交系Z31杂交,获得1 000个M1单株,自交构建M2群体,研究MuDR因子在基因组中插入位点特性.利用优化的MuTAIL-PCR方法分离出695条MuDR插入位点侧翼序列,经初步生物信息学分析得到374条非冗余的插入位点,其中的298条序列能够被定位在玉米基因组物理图谱单个位点上.实验结果揭示了MuDR因子插入的一些特性:在10条染色体上随机分布,偏向于插入到基因序列中,并在某些功能基因中有明显插入偏好.

关键词：玉米、Mutator转座子、MuDR因子、侧翼序列、插入位点、MuTAIL-PCR

所属期刊栏目：37

分类号：S88;S47

资助基金：the grants of"863" High-tech Program2006AA10A106;the China National Fundamental Fund of Personnel TrainingJ0730649;partly supported by the open funds of the National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

在线出版日期：2011-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：772-777