期刊专题

10.3724/SP.J.1006.2010.02035

干旱胁迫下棉花SSH文库构建及其抗旱相关基因分析

引用
以耐旱自交系邯郸177为材料,利用抑制性差减杂交技术(SSH),构建棉花苗期叶片的正向差减文库.挑取300个阳性克隆进行PCR验证,并对验证后的单克隆进行测序和分析,共获得284个有效序列.聚类后得到202条uniESTs序列,其中174条singlets,28条contigs.经过BlastN分析,156个unigene可以在GenBank中找到同源序列,46个unigene未能找到同源匹配.经BlastX分析,40个unigene与未知功能蛋白或假定蛋白有较高相似性,116条unigene与已知功能蛋白有较高同源性.用KOBAS系统将33个unigene定位到55个Pathways中,其中P值小于0.5的Pathway有23条.初步分析发现,丙酮酸盐代谢(pyruvate metabolism)途径、乙醛酸和二羧酸代谢(glyoxylate and dicarboxylate metabolism)途径与棉花抗旱相关性较大.这些unigene基因涉及信号传导、能量代谢、蛋白质代谢、核酸代谢、光合作用及膜运输等代谢过程.发现了苹果酸合成酶基因(Ms1,001_B03;Ms2,003_E04)、苹果酸脱氢酶基因(Md1,001_C12;Md2,002_F01);NAC(001_C08)、锌指蛋白(zfp,003_C06)、BZR1/BES1(003_G04)等转录调节因子,以及翻译控制肿瘤蛋白基因(TCTP,002_C04)等耐旱相关基因.

干旱胁迫、SSH、unigene、耐旱

36

S51;S71

国家农作物转基因生物新品种培育重大专项2008ZX08005-004;中央级公益性科研院所基本科研业务专项

2011-03-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共10页

2035-2044

相关文献
评论
暂无封面信息
查看本期封面目录

作物学报

0496-3490

11-1809/S

36

2010,36(12)

相关作者
相关机构

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn