棉纤维伸长阶段上、下调基因及相关通路的分析

摘要：

棉花纤维细胞是研究细胞发育机制的理想材料,陆地棉Ligon lintless(Li1)是单基因显性超短纤维突变体,其性状表现为长纤维极度缩短,分离得到的野生型(li1)纤维发育正常.本实验通过cDNA芯片的方法对2个材料进行比较分析,采集开花前1 d到开花后7 d材料,检测到多个上调和下调基因,选择2个基因(CIPK和XET)进行RT-PCR和qRT-PCR的芯片验证.应用MAS(molecular analysis system)系统进行GO功能注释和Pathway的分析表明,这些差异表达基因参与脂肪酸代谢(fatty acid metabolism)、甘油脂代谢(glycerolipid metabolism)以及碳同定(reductive carboxylate cycle)等多个代谢途径.这些基因在突变体Li1中的异常表达可能导致细胞中脂肪酸和脂肪含量变化,影响棉纤维细胞的正常发育.

关键词：基因通路图、脂肪酸、cDNA芯片

所属期刊栏目：36

分类号：S56;R73

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划项目2004CB117301;国家"十一五"科技支撑计划项目2006BAD13B04

在线出版日期：2011-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1891-1901