赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析

摘要：

以甘蔗ROC22为材料,在伸长初期进行叶面喷施200 mg L-1浓度的赤霉素为处理,以喷施清水为对照,在不同时间取幼茎样品,用cDNA-SCoT进行基冈差异表达分析.结果表明,通过46条引物筛选了约700个cDNA片段,获得差异片段30个.有18个基因片段受赤霉素上调而12个基冈片段下调;其中16个TDFs序列和NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,按照其功能可分为6类,即能量与代谢相关基因(占总数的20.0%)、未知功能蛋白(占总数的20.0%)、未知基因(占总数的46.7%)、信号传导相关基因(占总数的6.7%)、转录因子相关基因(占总数的3.3%)和细胞凋亡基因(3.3%).这说明利用SCoT方法可以进行蔗茎基因差异表达研究,分离到的一些差异片段可能是与甘蔗节间伸长相关的基因.

关键词：赤霉素、甘蔗、cDNA-SCoT、差异表达

所属期刊栏目：36

分类号：R73;S66

资助基金：国家科技支撑计划项目2007BAD30B03;广西科技攻关重点项目桂科攻0782004-3;广西科技攻关项目桂科能0630006-5F,桂科能0815011;现代农业产业技术体系建设专项资nycytx-024-01-15

在线出版日期：2011-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1883-1890