芥菜型油菜FAE1基因序列特征及其与芥酸含量关系的初步分析
采用同源序列法对6个芥菜型油菜(Brassica juncea)品种(高芥酸、中芥酸、低芥酸)、2份白菜型油菜品种(高芥酸和低芥酸)和 1 份黑芥品种的FAE1基因进行克隆和测序表明,9个品种的FAE1基因编码区全长均为1 522 bp,不含内含子,均编码507个氨基酸残基.序列比较表明,芥菜型油菜中有两种FAE1基因序列(BjFAE1.1和BjFAE1.2),其亲缘种白菜型油菜和黑芥中各有一种FAE1基因序列(BrFAE1和BnFAE1),BjFAE1.1对应于白菜型油菜的BrFAE1,BjFAE1.2对应于黑芥的BnFAE1;BjFAE1.1和BjFAE1.2之间存在71 bp处核苷酸变异和Hind Ⅲ不同的酶切位点(第1415位和第1144位),蛋白质水平上存在15处氨基酸变异.比较不同芥酸含量品种的FAE1基因序列表明,BjFAE1.1基因存在2个SNP位点(第968位和第1265位),BjFAE1.2基因也有2个SNP位点(第49位和第237位),这4个SNP位点中有3个位点(第49位、第968位和第1265位)导致蛋白质水平上氨基酸的差异.其中BjFAE1.1基因第968位的碱基变化(C→T)引起的第323位氨基酸变化(Thr→Ile),能够解释芥菜型油菜和白菜型油菜高芥酸到低芥酸(中芥酸)的转变;第1265位的碱基变化(T→C)引起的第422位的氨基酸变化(Phe→Ser),能够部分解释芥菜型油菜的高芥酸到低芥酸(中芥酸)的转变,白菜型油菜的高芥酸和低芥酸品种在该位点的碱基没有变化.BjFAE1.2基因第49位的碱基变化(T→C)引起的第17位氨基酸的变化(Phe→Leu),可以解释芥菜型油菜的中芥酸变成高芥酸(低芥酸).陕北黄芥低芥酸突变株1278→3的FAE1基因序列和国外低芥酸品种比较,只在第1265位出现变异.
芥菜型油菜、FAE1、克隆、序列分析
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S56;S63
陕西省自然科学基金项目2005C108;国家高技术研究发展计划863计划项目2009AA101105;西北农林科技大学唐仲英育种基金A212020523
2010-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
794-800
