干旱胁迫下斑茅消减文库的构建及分析

摘要：

以干旱胁迫下斑茅(Saccharum arundinaceum Retz.)叶片组织的cDNA为Tester,正常生长条件下斑茅叶片组织cDNA为Driver,利用抑制性消减杂交技术(Suppression Subtractive Hybridization, SSH)构建斑茅干旱胁迫消减文库.文库克隆总量约为30000个,克隆重组率为99.2%;随机从文库中挑取3500个克隆分析表明,插入片段长度主要集中在200～1000 bp之间,500 bp以上的有463个克隆,500 bp以下的有3037个克隆,平均长度约450 bp; 通过随机对16个文库阳性克隆的测序及分析,3个克隆与ATP-NAD kinase、Aldo/keto reductase和锌指蛋白高度同源,3个克隆没有同源性,10个与逆境相关,是功能未知的EST.选择编号为EL0149和EL0145两个克隆进行Northern杂交验证,结果表明EL0149克隆为干旱胁迫上调表达的EST序列,而EL0145在正常供水和干旱条件下均无明显的的杂交信号.说明本研究克隆的SSH文库质量较高,可以进一步利用SSH文库结合芯片表达谱分析作物水分胁迫下的相关抗旱基因网络.

关键词：斑茅、干旱胁迫、抑制性消减杂交、表达序列标签

所属期刊栏目：33

分类号：S5(农作物)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2001AA241191;国家自然科学基金30370901;高等学校博士学科点专项科研项目20040389009

在线出版日期：2007-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：961-967