基于全长cDNA序列的小麦cSNP发掘

摘要：

以测序得到的来自小麦不同基因组的基因序列为源序列,用AutoSNP软件,在GenBank中的小麦EST库中检测到一批cSNP,开辟了一条发掘小麦基因组特异候选cSNP的新途径.在2089个源序列中,检测到1 296个cSNP,其中有397个来自A基因组,322个来自S基因组,420个来自D基因组;另外,A和D基因组共有的SNP有154个,A和S,S和D,A、S和D基因组共有的SNP各仅有1个,这一结果也同时表明,小麦的3个基因组供体种中,A、D基因组关系比较近,而它们与S基因组的关系比较远.统计分析表明,小麦中SNP出现的频率约为0.914‰.

关键词：单核苷酸多态性、基因组供体、转换、颠换、单体型

所属期刊栏目：32

分类号：S5(农作物)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划G2004011702

在线出版日期：2007-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1836-1840