玉米AFLP指纹图谱的引物选择研究

摘要：

AFLP分子标记技术将对玉米品种指纹文库的构建发挥巨大作用,因此对玉米AFLP指纹图谱的引物选择研究具有重要意义.通过研究发现:①用MseⅠ和EcoRⅠ酶切后,酶切位点后第一个碱基T占的比例高达30%左右,其次A占27%左右,G、 C占的比例较少,为21%左右.第二个碱基T占27%左右,A、 G、 C分别占24%左右较均匀.因此以TT选择引物时扩增的谱带较多.②不同引物扩增的谱带的多态性不同,多态性强的引物组合可分为两类.其一为多态性主要由一端引物产生的;其二为多态性由两端共同决定的.对多态性贡献较大的两个引物组合可能产生更高的多态性.③随引物选择碱基的增加,扩增的谱带数有所降低.同时增加一个选择碱基,在M端增加一个选择碱基较在E端增加一个选择碱基,谱带数目降低较多.④在多态性较高的2+2引物组合中,增加第3个选择碱基,可选出多态性更强的引物组合.⑤选择多态性强的引物组合可按如下程序:第一步选择2～4组亲缘关系相近的材料6～12个.第二步,将两端碱基相同的2+2引物组合(16对)全部选择扩增,以筛选有多态性的2+2引物组合.第三步,重组有多态的2+2引物,以筛选多态性较强的2+2引物.第四步,将多态性较强的2+2引物一端分别增加第3个选择碱基,筛选多态性高谱带质量好的2+3或3+2引物组合.根据这一程序,选出MGAEGAG和MGAAEGA两引物组合,扩增谱带多态性强、谱带数目多、且质量好,可作为玉米AFLP指纹的高多态引物.⑥杂交种的指纹包含了双亲的所有带型,即双亲有差异的谱带在F1代同时表现.

关键词：玉米、指纹、AFLP、引物选择

所属期刊栏目：28

分类号：S513.032(禾谷类作物)

资助基金：国家科技攻关项目96-014-01-06

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：221-226