N端6-甲基辛酰基化修饰对小肽KTKKKFLKKT结构的影响

摘要：

得到生物活性肽的三维结构,有助于预测和理解其功能机理.研究发现对小肽KT-KKKFLKKT的N端进行6-甲基辛酰基化修饰后,其细胞毒性增强.用nnPredict服务器预测,发现该小肽具有α螺旋二级结构序列特征.为研究此修饰造成该小肽细胞毒性增强的分子机理,用AM-BER软件对该小肽进行全原子折叠模拟,发现其最低能量结构确实形成右手α螺旋,再对该结构的N端进行6-甲基辛酰基化修饰后,以分子动力学模拟计算,发现6-甲基辛酸可通过与氨基酸侧链间的疏水作用破坏小肽最低能量结构的α螺旋,增强了该小肽疏水相互作用,这可能是此修饰造成该小肽细胞毒性增强的原因所在,这为指导实验研究其细胞毒性分子机理和进一步修饰设计奠定了基础.

关键词：生物活性肽、酰基化修饰、广义波恩模型、全原子结构预测折叠

所属期刊栏目：19

分类号：X79;TS3

资助基金：国家重点基础研究发展计划001CB510208,2009CB918301;国家自然科学基金30430310和30670791

在线出版日期：2009-11-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1056-1061