基于TCGA数据库构建肝癌铜死亡的预后模型

摘要：

目的 构建肝细胞癌(HCC)患者铜死亡相关基因(CRGs)的预后模型.方法 基于TCGA数据库HCC患者的mRNA数据集,分析CRGs在HCC患者中的表达,对CRGs及相关基因进行GO和KEGG富集分析.Kaplan-Meier生存分析曲线评估CRGs的生存预后价值,分析其与免疫细胞浸润的相关性.单因素Cox回归分析筛选出与HCC患者生存预后显著相关的CRGs,Lasso回归和多因素Cox回归分析构建预后模型.根据风险值对患者进行分组并进行生存分析,ROC曲线评估预后模型,单因素和多因素Cox回归分析风险评分及临床因素与预后的关系.结果 分析得到HCC中差异表达CRGs共11个,CRGs及其相关基因主要富集的GO条目为氧化还原酶活性,作用于供体的醛基或氧基,主要富集的KEGG信号通路为碳代谢.CRGs的表达水平与浆细胞样滤泡树突细胞、T辅助细胞等免疫细胞的浸润显著相关(P<0.05).筛选并构建3个CRGs的预后模型,包括CDKN2A、DLAT和LIPT1.高风险组和低风险组的生存时间存在显著差异(P<0.001).风险评分是预后不良的独立危险因素(P<0.001).结论 基于TCGA数据库数据构建CRGs的HCC患者预后模型,可为评估HCC患者的预后提供思路.

关键词：铜死亡、肝细胞癌、TCGA数据库、预后模型

所属期刊栏目：50

分类号：R735(肿瘤学)

资助基金：重庆市自然科学基金面上项目;重庆市科卫联合医学科研项目

在线出版日期：2023-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：276-282