基于细胞焦亡与炎症反应相关基因构建肝细胞癌预后风险评估模型及验证

摘要：

目的 基于细胞焦亡与炎症反应相关基因构建肝细胞癌预后风险评估模型,并进一步探索该模型对肿瘤免疫微环境状态的预测效能,为制定个性化的治疗方案提供方向.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库(365例)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库(231例)下载有关肝细胞癌样本的细胞焦亡和炎症反应基因的mRNA数据,通过Lasso Cox回归分析构建肝细胞癌预后风险评估模型,计算细胞焦亡与炎症反应评分(PIRS).采用R语言进行生存预后分析及临床病理特征分析;单样本基因集富集分析(GSEA)以及肿瘤免疫功能障碍与逃逸预测肿瘤免疫微环境状态;GSEA分析PIRS相关的信号通路及生物学功能.结果 TCGA数据库中64个基因与肝细胞癌患者的总生存期有关(P<0.05),筛选出15个基因构建肝细胞癌预后风险评估模型.Kaplan-Meier生存分析显示,高风险组的总生存期较低风险组短(P<0.01).TCGA数据库中PIRS的AUC在1、2和3年时分别为0.871、0.846和0.831,ICGC数据库中AUC分别为0.844、0.733和0.751.PIRS是肝细胞癌患者预后的独立预测指标(HR=2.802,95％CI:2.286～3.433,P<0.01).高风险组中免疫杀伤细胞含量、细胞毒反应和干扰素活性均低于低风险组(均P<0.01),但巨噬细胞含量、免疫功能障碍评分和T细胞驱逐评分均高于低风险组(均P<0.01).高风险组中富集了细胞周期、血管内皮生长因子和转化生长因子β等相关信号通路.结论 PIRS与肝细胞癌患者预后有关,高风险组处于免疫抑制状态,肝细胞癌预后风险评估模型能准确预测患者预后.

关键词：细胞焦亡;炎症反应;肝细胞癌;预后;肿瘤微环境;靶向治疗

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资助基金：江苏省镇江市科技局社会发展项目SH2021068

在线出版日期：2022-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：250-257,后插1-后插2