基于TCGA和GEO数据挖掘分析PRC1在肺腺癌中的表达及预后意义

摘要：

目的 探讨肺腺癌(LUAD)组织中胞质分裂蛋白调节因子1(PRC1)的表达及其对LUAD患者预后的影响.方法 通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析PRC1 mRNA在33种肿瘤中的表达情况,并用人类蛋白质图谱(HPA)数据库的免疫组化结果验证PRC1蛋白在LUAD中的表达.通过肿瘤基因图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库获得PRC1在LUAD中的表达数据及相关临床特征参数,分析PRC1 mRNA表达水平与LUAD患者的临床特征、总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)的关系.采用基因集富集分析(GSEA)预测PRC1相关的基因通路.结果 TIMER数据库分析结果显示,17种肿瘤组织中PRC1 mRNA表达水平均高于正常对照组织.TCGA数据库、GSE31210和GSE75037数据集结果提示,LUAD组织中PRC1 mRNA表达水平均明显高于正常对照组织或癌旁正常组织,差异均有统计学意义(均P<0.01).HPA数据库的免疫组化结果提示,PRC1蛋白在LUAD组织中呈高表达.TCGA数据库分析结果提示,PRC1 mRNA表达水平与LUAD患者的性别、吸烟、T分期、N分期和TNM分期均有关(均P<0.01).TCGA数据库、GSE31210和GSE68465数据集结果提示,除GSE68465数据集中的PFS外,其余PRC1高表达组患者PFS和OS均差于低表达组(均P<0.05).单因素和多因素Cox分析表明,PRC1 mRNA表达水平是影响LUAD患者OS和PFS的独立危险因素(均P<0.05).GSEA结果提示,PRC1高表达样本富集在有丝分裂纺锤体、G2M检查点、E2F信号通路、DNA修复等基因集中.结论 LUAD中PRC1 mRNA表达水平上调,PRC1高表达提示LUAD患者的预后差,可作为LUAD患者治疗的潜在靶点.

关键词：肺腺癌、胞质分裂蛋白调节因子1、肿瘤基因图谱数据库、基因表达综合数据库、预后

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资助基金：浙江省医药卫生科技计划项目2019326546、2021424096

在线出版日期：2021-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：482-487