INMT基因在肝癌中的表达及其机制研究

摘要：

目的 应用生物信息学分析探讨吲哚胺N-甲基转移酶(INMT)在肝癌发生、发展中的作用及可能的机制,为肝癌的防治提供生物信息学依据.方法 本研究从TCGA下载肝癌RNA测序数据库及患者临床资料,包含371例肝癌患者的癌组织以及50例肝癌患者的癌旁组织;GSE102079肝癌基因芯片数据从GEO下载,芯片共包含152例肝癌患者的癌组织和91例肝癌患者的癌旁组织.采用R语言分析INMT在TCGA和GSE102079中肝癌组织和癌旁组织的表达差异以及与预后的相关性;分析两个数据库中INMT相关基因的蛋白相互作用网络,对重叠基因进行GO和KEGG通路富集分析,采用STRING数据库构建INMT的相关基因互作蛋白网络.结果 和癌旁组织相比较,INMT基因在肝癌组织中显著低表达(P<0.01).与INMT低表达肝癌患者相比较,INMT高表达肝癌患者总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)显著延长(P<0.01).TCGA和GSE102079肝癌数据库中INMT的相关基因共有178个重叠,主要涉及PI3K-AKT信号通路、细胞黏附分子、肿瘤信号通路、细胞黏附、血管形成等生物过程.构建INMT相关基因的蛋白相互作用网络,发现COL14A1、FBLN1/2、PECAM1、EMCN、FLT4等在INMT相关基因的蛋白相互作用网络中发挥关键作用,为进一步探讨INMT在肝癌中发挥作用的下游机制研究提供生物信息学依据.结论 INMT可能在肝癌中发挥抑癌基因的作用,与肝癌的预后较好显著相关.

关键词：吲哚胺N-甲基转移酶、肝癌、预后、生物信息学分析

所属期刊栏目：43

资助基金：国家自然科学基金;广东省自然科学基金

在线出版日期：2021-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：20-25