miR-340在膀胱尿路上皮癌中的表达及其靶基因预测的生物信息学分析

摘要：

目的 探讨miR-340在膀胱尿路上皮癌中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析,为miR-340在膀胱尿路上皮癌发生中的作用机制研究提供理论基础.方法 采用miRNA芯片技术检测膀胱尿路上皮癌及正常膀胱黏膜组织中miRNA表达谱,用实时定量PCR法进行验证,挑选具有显著表达差异的miR-340为进一步研究对象,利用生物信息学方法,对miR-340的靶基因进行预测,并对其靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析及KEGG信号转导通路富集分析.结果 miRNA表达谱芯片、实时定量PCR法均提示miR-340在膀胱尿路上皮癌中较癌旁正常膀胱组织中表达明显降低.miR-340预测靶基因集合功能富集于细胞黏附(cell adhesion)、生物黏附(biological adhesion)和细胞间黏附(cell-cell adhesion)等,KEGG通路分析涉及癌通路(pathways in cancer)和细胞周期通路(pathways in cell cycle)等.结论 miR-340在膀胱尿路上皮癌中呈低表达,miR-340预测靶基因集合显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中.

关键词：miR-340、膀胱肿瘤、靶基因、生物信息学

所属期刊栏目：40

资助基金：浙江省医药卫生科技计划2017ky152

在线出版日期：2018-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：560-563