稀杯盔形珊瑚转录组分析

摘要：

以高通量测序技术Illumina HiSeqTM2000对稀杯盔形珊瑚（Galaxea astreata）进行转录组测序分析，共获得50360620条短序列(reads)。利用Trinity软件对所有reads从头组装后得到81014条单基因簇(Unigenes)，60471条(74.58％)编码蛋白框（Coding Sequences,CDs）。与Nr（Non-redundant,非冗余）、COG（Cluster of Orthologous Groups of proteins,蛋白相邻类的聚簇）、KEGG（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,京都基因与基因组百科全书）、Swissprot四大数据库比对共获得36545条注释基因。其中与COG数据库比对获得14491条注释基因，分为24个功能类别，其中参与一般功能预测类的Unigene数最多，有4642条；KEGG分析比对获得16021条注释基因，分成241类，包括代谢通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路等,在所有通路中参与代谢途径的基因数最多，共有2450条(15.29％)；GO(Gene Ontology,基因本体)功能分类将Unigene分为47个类别。

关键词：转录组、稀杯盔形珊瑚、Unigene、信号通路

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家海洋公益性行业科研专项201105012;广东省自然科学基金项目S2011010000269;广东省海洋渔业科技推广专项A201308E02

在线出版日期：2016-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

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