hsa-miR-422a靶基因在增生性瘢痕中的表达及生物信息分析

摘要：

目的:检测hsa-miR-422a在增生性瘢痕的表达，用生物信息学方法预测其靶基因，并分析其生物学功能。方法:2020年6—12月，上海交通大学医学院附属第九人民医院整复外科收集3份增生性瘢痕组织和3份上睑单睑患者皮肤组织(男3例，女3例，年龄20~42岁，平均28.3岁)，分离培养成纤维细胞，用实时定量PCR检测hsa-miR-422a表达；用starBase和TargetScan数据库预测hsa-miR-422a靶向基因及长链非编码RNA(lncRNAs)，构建ceRNA网络。对hsa-miR-422a靶基因进行GO功能注释和KEGG通路分析；通过构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络筛选关键基因，并预测其生物学功能。用实时定量PCR检测验证关键靶基因在增生性瘢痕组织的表达。结果:增生性瘢痕组织和成纤维细胞中，hsa-miR-422a表达量明显低于正常皮肤(
P<0.05)。starBase和TargetScan数据库预测到hsa-miR-422a靶向的133个基因和1 033个lncRNA，由此构建以hsa-miR-422a为中心的ceRNA网络。靶基因PPI网络分析筛选出MAPK1、GRB2和IGF1R等10个关键基因，其功能主要与蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活动、泛素蛋白连接酶结合、成纤维细胞生长因子受体通路、肌细胞增殖等相关，且主要富集于FoxO、mTOR、Toll样受体、Ras、MAPK、PI3K-Akt、干细胞调控等通路。关键靶基因MAPK1、GRB2和IGF1R在增生性瘢痕组织中表达明显高于正常皮肤(
P<0.05)。
结论:hsa-miR-422a在增生性瘢痕表达较低，可能与MAPK1等关键靶基因构成ceRNA网络，在增生性瘢痕的发生发展中发挥调控作用。

关键词：瘢痕，肥大性、基因、hsa-miR-422a、生物信息学、竞争性内源RNA、富集分析

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资助基金：国家自然科学基金81772086, 82072177;National Natural Science Foundation of China81772086, 82072177

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6