健康老年人肠道菌群宏基因组与16S rDNA测序的比较研究

摘要：

目的:基于健康老年人群的肠道菌群组成特征，探索宏基因组测序与16S rDNA测序在后续分析上的差异。方法:采用定群研究设计，对山东济南76名健康老年人进行5次重复测量，采集粪便样本并提取基因组DNA，分别进行宏基因组与16S rDNA测序，比较两种测序肠道菌群的组成与多样性；采用Pearson相关分析物种丰度与α多样性的相关性，普氏分析判断β多样性的相关性。结果:76名老年人年龄（65.07±2.75）岁，体重指数为（25.03±2.40）kg/m
2；男、女各38名；5次重复测量共得到345人次的粪便样品。相较于16Sr DNA测序，宏基因组测序在各个水平的注释物种数更多，且水平越低，两种测序物种数量相差越大；两种测序的物种丰度存在差异，但在门（
r=0.88，
P<0.001）、属（
r=0.77，
P<0.001）水平上物种丰度呈高度相关，其中拟杆菌门、厚壁菌门等是共同的优势物种；老年人肠道菌群多样性分析显示，两种测序的α多样性指数存在显著正相关（
r=0.70，
P<0.001），两组β多样性也呈显著相关（
M
2=
0.84，
P<0.05）；
结论:宏基因组测序注释效率远高于16S rDNA测序；两种测序方法在门水平物种丰度、物种α多样性上具有较高的一致性。

关键词：老年人、肠道微生物、多样性、高通量测序

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资助基金：大气重污染成因与治理攻关项目DQGG0401;中国疾病预防控制中心环境所青年科学基金项目2020YSRF_03;National Research Program for Key Issues in Air Pollution Control, ChinaDQGG0401;Young Scholar Scientific Research Foundation of National Institute of Environmental Health, China CDC2020YSRF_03

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1618-1624